MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 7734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022784	CA	3	6	954653	954658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6502	NC_022784	CTTTG	2	10	954669	954678	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6503	NC_022784	AGT	2	6	954725	954730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_022784	TCA	2	6	954811	954816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_022784	TTGC	2	8	954831	954838	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6506	NC_022784	TCA	2	6	954862	954867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_022784	AGT	2	6	954974	954979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_022784	ACC	2	6	955090	955095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6509	NC_022784	TCC	2	6	955129	955134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6510	NC_022784	TCT	2	6	955171	955176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_022784	CTTG	2	8	955323	955330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6512	NC_022784	TAA	2	6	955346	955351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_022784	AT	3	6	955495	955500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_022784	GTC	2	6	955521	955526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_022784	ATT	2	6	955650	955655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_022784	CGTTG	2	10	955658	955667	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6517	NC_022784	CAA	2	6	955676	955681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_022784	GCC	2	6	955691	955696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6519	NC_022784	TC	3	6	955713	955718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6520	NC_022784	GGC	2	6	955759	955764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_022784	CAA	2	6	955829	955834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_022784	CGC	2	6	955887	955892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6523	NC_022784	TGC	2	6	955920	955925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_022784	CAG	2	6	955932	955937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_022784	TCT	2	6	955944	955949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_022784	TACA	2	8	955967	955974	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6527	NC_022784	TAAA	2	8	956054	956061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_022784	TGC	2	6	956211	956216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_022784	AC	3	6	956326	956331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6530	NC_022784	CGC	2	6	956345	956350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6531	NC_022784	AGA	2	6	956382	956387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_022784	GGC	2	6	956404	956409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_022784	GCC	2	6	956413	956418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6534	NC_022784	CAC	2	6	956428	956433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6535	NC_022784	CCG	2	6	956446	956451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6536	NC_022784	ACACTT	2	12	956486	956497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_022784	CTTG	2	8	956694	956701	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6538	NC_022784	GAA	2	6	956704	956709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_022784	ATG	2	6	956719	956724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_022784	CTT	3	9	956748	956756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_022784	ATG	2	6	959258	959263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_022784	TGA	2	6	959722	959727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_022784	CAAC	2	8	959837	959844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6544	NC_022784	GGCC	2	8	959853	959860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6545	NC_022784	TGT	2	6	959964	959969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_022784	T	6	6	959979	959984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_022784	TGC	2	6	960070	960075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_022784	GAAA	2	8	960078	960085	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_022784	CA	3	6	960133	960138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6550	NC_022784	GATT	2	8	960178	960185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_022784	GC	3	6	960306	960311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6552	NC_022784	TATG	2	8	960315	960322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_022784	CTCC	2	8	960323	960330	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6554	NC_022784	AAT	2	6	960333	960338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_022784	CGTG	2	8	960401	960408	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6556	NC_022784	TTA	2	6	960483	960488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_022784	GTA	2	6	960511	960516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_022784	GAT	2	6	960526	960531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_022784	AGT	2	6	960549	960554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_022784	N	39	39	960621	960659	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_022784	CTG	2	6	960664	960669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_022784	CAT	2	6	960704	960709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_022784	AAT	2	6	960740	960745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_022784	ATC	2	6	960759	960764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_022784	ACC	2	6	960798	960803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6566	NC_022784	GCC	2	6	960804	960809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6567	NC_022784	GGC	2	6	960822	960827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_022784	A	6	6	960975	960980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_022784	ACT	2	6	960994	960999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_022784	ATG	2	6	961042	961047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_022784	ATTAC	2	10	961105	961114	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6572	NC_022784	ATC	2	6	961137	961142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_022784	GCC	2	6	961149	961154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6574	NC_022784	CCG	2	6	961156	961161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6575	NC_022784	CCT	2	6	961171	961176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6576	NC_022784	TAC	2	6	961193	961198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_022784	TGT	2	6	961216	961221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_022784	AGC	2	6	961236	961241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_022784	TTA	2	6	961253	961258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_022784	GCA	2	6	961259	961264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_022784	CCG	2	6	961277	961282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6582	NC_022784	TAC	2	6	961296	961301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_022784	CTCTTA	2	12	961325	961336	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_022784	TTA	2	6	961352	961357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_022784	AGC	2	6	961360	961365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_022784	AACA	2	8	961454	961461	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6587	NC_022784	CT	3	6	961497	961502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6588	NC_022784	AAG	2	6	961614	961619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_022784	CG	3	6	961738	961743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6590	NC_022784	CA	3	6	961846	961851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6591	NC_022784	AGT	2	6	961879	961884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_022784	TGCA	2	8	961906	961913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6593	NC_022784	GCG	2	6	961959	961964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_022784	AAC	2	6	962003	962008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_022784	ACCA	2	8	962135	962142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6596	NC_022784	GT	4	8	962232	962239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_022784	TGC	2	6	962520	962525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_022784	ATT	2	6	962563	962568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_022784	ATGT	2	8	962590	962597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_022784	GGA	2	6	962614	962619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_022784	TCA	2	6	962680	962685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_022784	CAG	2	6	962686	962691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_022784	CTA	2	6	962695	962700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_022784	CAG	2	6	962714	962719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_022784	CTG	2	6	962728	962733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_022784	CAT	2	6	962795	962800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_022784	GGT	2	6	962807	962812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_022784	CAT	2	6	962825	962830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_022784	TG	3	6	962871	962876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_022784	N	22	22	962893	962914	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_022784	GTG	2	6	962955	962960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_022784	GCAGCC	2	12	963039	963050	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6613	NC_022784	CTG	2	6	963062	963067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_022784	GAT	2	6	963073	963078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_022784	TGT	2	6	963090	963095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_022784	GTTG	2	8	963213	963220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_022784	TGC	2	6	963267	963272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_022784	TGG	2	6	963289	963294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_022784	N	320	320	963329	963648	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_022784	TAT	2	6	963649	963654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_022784	GTGA	2	8	963692	963699	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_022784	GTG	2	6	963714	963719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_022784	ATG	2	6	963720	963725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_022784	TCC	2	6	963772	963777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6625	NC_022784	AAGT	2	8	963806	963813	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_022784	CA	3	6	963818	963823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6627	NC_022784	ATC	2	6	963921	963926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6628	NC_022784	AGA	2	6	965890	965895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_022784	TGA	2	6	965931	965936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_022784	GCA	2	6	965939	965944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6631	NC_022784	ATT	2	6	965988	965993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6632	NC_022784	GA	3	6	966014	966019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6634	NC_022784	AATT	2	8	966036	966043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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